本館的藏品綜合的囊括了近代以後的京都美術（日本畫，西洋畫，雕刻，版畫，工藝品，書法）。特別是作爲展品核心的京都畫壇的大量作品，不僅代表了近代日本畫，深受業界内外的認可與贊譽。現在的作品包括藝術家本人·家屬，收藏家們捐贈的作品共4400多件。在翻新開館之後，將新設常設展覽室公開一部分藏品。